进化尺度建模(ESM)蛋白质语言模型下游应用综述

摘要

该综述关注进化尺度建模（ESM）系列蛋白质语言模型（PLM）的下游应用。这类模型在大量无标注蛋白质序列数据上训练，能够学习进化过程中塑造蛋白质家族的突变与保守模式，被认为是大语言模型（LLM）与蛋白质表征交汇的重要创新。ESM已成为蛋白质表征及下游生物学任务中广泛使用的基础模型家族。