CircuitATLAS: 基于系统神经科学知识图谱的智能体推理用于回路病靶点发现

摘要

神经疾病药物发现聚焦疾病改变的分子，但致病分子未必是逆转病理的最佳控制点。CircuitATLAS 是来源可追溯的系统神经科学知识图谱与智能体框架，用于回路病靶点发现。图谱覆盖疾病、表型、电生理、回路、脑区、细胞类型和分子效应器，刻意排除疾病-基因和疾病-蛋白直接边以减少捷径推理；含 383 万节点、766 万边，其中 531 万 LLM 提取关系，纳入 Human Cell Atlas 等数据集和新的多模态体内测量。智能体工作流从可测表型经回路与细胞基质推理到分子干预、治疗可行性和临床约束；人类监督的体内 lab-in-the-loop 连接假设生成与实验迭代。智能体提名 ATP1A3 为皮层兴奋性控制点；中间神经元限制性表达 ATP1A3 在体内消除了对局部 4-aminopyridine 挑战的 beta 和 gamma 波段反应；验证靶点进入结构引导小分子项目，defined assay 确定调控方向。