AI 引导设计完整噬菌体基因组: Evo 模型给出 302 个候选

摘要

King 等人在 Science 上报告了用生成式 AI 设计完整细菌噬菌体基因组。所用基因组语言模型 Evo 1 与 Evo 2 在大规模 DNA 序列数据上预训练，其中包含超过 200 万条噬菌体基因组。生物信息学基准测试显示，模型生成的序列真实，且多样性超出自然界所见。作者以裂解性 Microviridae 噬菌体 ΦX174（基因组约 5.4 kb、含 11 个基因）为设计模板，用约 15,000 条 Microviridae 序列做监督微调，生成 ΦX174 样基因组，再按序列质量、嗜性特异性和进化多样性进行计算筛选，得到 302 个候选噬菌体基因组。该预览未报告这些候选的实验验证。