对话DeepMind与Biohub: AlphaFold为何没有真正解决蛋白质折叠

摘要

Google DeepMind的Pushmeet Kohli与Biohub的Sal Candido在Brandon Anderson主持的一场特别对谈中，讨论了AI驱动生物学的边界。他们认为AlphaFold的突破只是开始，仅靠扩大算力与数据规模不足以解决生物学问题：找到合适的标度律比盲目增大模型更重要，低质量宏基因组数据也可能改进蛋白质语言模型。对谈还涉及蛋白质结构预测远未解决、蛋白质动态与无序区、静态结构预测的局限、冷冻电镜图像能否带来更丰富的表征，以及从单个蛋白质模型走向整套生物系统与虚拟细胞所需的根本不同数据集。Candido表示，要实现Biohub治愈所有疾病的使命，需要10倍量级的突破而非渐进改进。