Recon3D 代谢反应活性图神经网络评分基准中的标签泄漏与输入失效审计

摘要

研究者对其图注意力评分器 MetaGNN 进行自审，评估其在 TCGA 结直肠癌（n=624）、乳腺癌（n=1,095）和肺腺癌（n=517）队列上的结果。以同一转录组矩阵阈值化所得标签监督时，TCGA-BRCA 的 AUROC 为0.9864±0.0008，但其中5,925个反应标签是输入的确定性阈值，另有4,675个标签可由固定伪随机数生成器逐位复现，模型会记忆患者不变标签。经核查，独立于输入监督的存档模型特征张量全为零。重建并验证特征后，AUROC降至0.5800±0.0017，低于原始表达基线0.6342±0.0058及无信息指示器基线0.6085；作者撤回此前归因于关系边的+0.105 AUROC增益。