制药公司私有蛋白结构显著提升AI蛋白折叠模型性能

摘要

制药企业联合体报告称，用企业私有蛋白结构训练蛋白折叠AI模型可明显提升性能：研究者基于AlphaFold 3的开源复现版本OpenFold3，用超过20,000个专有结构训练新模型，表现优于仅用公开数据或各公司孤立数据集训练的模型。该研究以博客文章发布，尚未经同行评审，模型未公开。哥伦比亚大学计算生物学家Mohammed AlQuraishi认为这为建立类似公开数据集提供了依据；英国政府资助最高£800万（1,080万美元）的OpenBind项目上月已发布数百个结构。蛋白数据库(PDB)收录超过200,000个实验结构，但其中与类药物分子互作的结构可能仅约10,000个。