Detectrons: 将瞬时RNA序列转化为稳定DNA条形码的模块化生物传感器

摘要

研究者介绍模块化生物传感器 Detectrons，它将可编程的 toehold 开关与 retron 介导的逆转录耦合，把 RNA 输入转导为独特 DNA 条形码，从而在活细胞内把动态 RNA 信号变为持久 DNA 记录。该框架支持转录本感知的替代模式，应用包括病毒感染检测。作者构建了合成 toehold retron 文库并结合机器学习，总结出提升信号强度与特异性的关键设计原则。Detectrons 被用于多重活细胞检测特定噬菌体感染，实现转录本触发的条形码合成，并在混合细菌群体中进行定量的宿主易感性分析，为噬菌体筛选以及复杂细菌群落中转录事件的记录提供可扩展、可泛化的策略。