AIntibody challenge: 511款AI设计抗体靶向SARS-CoV-2 RBD, 首项亲和力成熟测试总体逊于实验抗体

摘要

这篇评论认为，抗体设计目前是AI药物发现中较可实现的用例之一：抗体在进化上被优化以获得较长血浆半衰期，已获批抗体药物也表明成功存在。但这是相对尺度，仍可能出错，包括靶点选择（如近期抗IL-6在心血管适应症上的失败）、靶点特异性以及免疫原性；大规模人群免疫系统差异使免疫原性难以预测，计算方法帮助有限。文章以AIntibody challenge为例：29家机构的511款AI设计抗体均靶向SARS-CoV-2受体结合域（RBD）。第一项测试为对已知RBD抗体的亲和力成熟，参与者仅获母抗体亲和力，未获酵母展示所得成熟序列，目标是在不损害已知可开发性因素下提高亲和力。结果显示AI提交抗体的总体分布逊于实验衍生抗体；节选在“Most（……”处中断。