CZ Biohub发布“ESM Atlas”, ESMFold2预测11亿蛋白质结构并称超越AlphaFold

摘要

据《自然》27日报道，美国生物医学研究机构 CZ Biohub 发布“ESM Atlas”数据库，其中收录其AI模型ESMFold2预测的11亿个蛋白质结构和68亿条蛋白质序列，结构数据比AlphaFold数据库多8亿。ESMFold2基于团队2024年发布的蛋白质语言模型，训练数据含来自生物体的数十亿蛋白质数据，包括未纳入AlphaFold数据库的宏基因组。CZ Biohub称其性能优于包括AlphaFold3在内的其他模型，能更准确预测抗体-抗原等复合物结构，并设计出与癌症、免疫疾病相关蛋白强结合的新型抗体和蛋白质，实验室验证与预测一致。专家看法不一：有人视之为重要新资源，也有人质疑其性能。