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基于集成元聚类框架的儿童低级别胶质瘤高分辨率亚型分型

摘要

儿童低级别胶质瘤(pLGG)约占儿童中枢神经系统肿瘤的30%,存在多种分子亚型,其疾病进展、复发模式和治疗反应各异。传统湿实验分型耗时、昂贵且费力,现有AI/ML方法多只能识别两三种亚型。研究者提出集成元聚类框架Meta-pLGG,对532例pLGG患者的转录组数据进行多轮随机投影降维,分别以层次聚类、K-means、SOM、NMF、GMM和谱聚类作为基础聚类方法,再用加权元聚类(wMetaC)整合结果。该框架在更高分辨率pLGG分型中稳定性和判别力优于传统方法;共识矩阵分析识别出两个pLGG mega亚型,并进一步分成五个亚组,各亚组表现出显著的亚型特异转录组异质性。

证据与核对

发现渠道
bioRxiv Latest
原始材料
www.biorxiv.org
材料类型
来源网页;材料类型未核实
材料范围
获取范围未知
复核状态
未标记人工复核